Seudo

27 de marzo de 2023

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por Science China Press

Recientemente, el equipo de investigación dirigido por el Dr. Shunping He del Instituto de Ciencias e Ingeniería del Mar Profundo de la Academia de Ciencias de China, publicó los resultados de su investigación en la versión en línea de Science China Life Sciences.

Informaron sobre el primer genoma de alta calidad de una anguila de aguas profundas (Ilyophis brunneus), que arroja luz sobre los mecanismos moleculares de la adaptación a las profundidades marinas. La muestra de anguila de aguas profundas fue obtenida por el sumergible tripulado de China, "Shen Hai Yong Shi", a una profundidad de 3.500 metros en la Fosa de las Marianas. Los investigadores identificaron a la anguila como una anguila diente de flecha fangosa (MAE) a través de la observación morfológica y el análisis de códigos de barras mitocondriales.

Para investigar los mecanismos moleculares de la adaptación a las profundidades marinas en la anguila, los investigadores primero secuenciaron y ensamblaron un genoma de alta calidad del MAE utilizando las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento de Illumina, PacBio y Hi-C. Luego realizaron análisis filogenéticos y genómicos comparativos para dilucidar su origen y mecanismos de adaptación.

El estudio reveló que varios genes críticos relacionados con el mantenimiento y la regulación del citoesqueleto habían sufrido mutaciones específicas, como los genes TUGBCP3 e ITGA, que experimentaron una fuerte selección positiva. TUBGCP3 es un componente esencial del complejo γ-tubulina y juega un papel crucial en la nucleación de microtúbulos en el centrosoma, mientras que ITGA promueve la estabilidad del citoesqueleto de microtúbulos y regula el ensamblaje del citoesqueleto.

Los investigadores también encontraron que una gran cantidad de familias de genes experimentaron expansión, selección positiva y evolución rápida, que estaban relacionadas con la capacidad de reparación del ADN, la fluidez de la membrana, los procesos normales de transcripción y traducción y el metabolismo energético.

Además, el análisis de presión de selección de anguilas de aguas profundas, anguilas europeas y otras especies de peces de aguas poco profundas reveló que el valor ω de las anguilas de aguas profundas era significativamente más alto que el de otras especies de peces, lo que sugiere que la anguila de aguas profundas probablemente experimentó una evolución funcional acelerada en el entorno extremo de las profundidades marinas. Estas variaciones genéticas pueden haber permitido que la anguila de aguas profundas desarrollara su capacidad de adaptarse a entornos extremos de aguas profundas.

Más información: Jie Chen et al, Pseudo-cromosoma: ensamblaje del genoma de longitud para una anguila de aguas profundas Ilyophis brunneus arroja luz sobre la adaptación de aguas profundas, Science China Life Sciences (2023). DOI: 10.1007/s11427-022-2251-8

Información del diario:Ciencias China Ciencias de la vida

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